МОДЕЛИРОВАНИЕ ФОРМЫ ШАПЕРОНИНОВ ПО КРИВЫМ МАЛОУГЛОВОГО РЕНТГЕНОВСКОГО РАССЕЯНИЯ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ФОРМФАКТОРА ТОРА
Амарантов С.В., Налетова И.Н., Курочкина Л.П.

Поступила в редакцию: 22 Октября 2010

DJVU (542.6K)

PDF (5.7M)

Для белковых комплексов, поверхности которых можно описать набором простейших двусвязных форм, получено решение обратной задачи рассеяния в однородном приближении (рассеивающий потенциал внутри объема молекулы - постоянная величина). Для эксперимента были взяты растворы двух белков: хорошо известного бактериального шаперонина GroEL и малоизученного фагового шаперонина - продукта гена 146 (gp146). По экспериментальным кривым рассеяния было продемонстрировано устойчивое восстановление формы белковых комплексов. При восстановлении формы этих частиц использовались метод оболочек, метод вращения аминокислотных последовательностей с использованием формфактора аминокислоты, метод поиска параметров модели белкового комплекса с предварительно полученным формфактором модели.